疾病评价指标计算系统、方法及程序与流程

【】本发明的实施方式涉及计算使用肠内细菌丛的疾病评价指标的技术，特别涉及对于提出采便的受试者提供显示对于特定的疾病的风险的评价报告的技术。

背景技术

0、
背景技术：

1、开发了计算使用生物(人等)的肠内细菌丛的疾病评价指标的技术。专利文献1公开了，提出采便、并且，对于耗工回答疾病罹患状况等的详细的问卷的受试者，提供显示对于特定的疾病的风险的评价报告的技术。

2、【现有技术文献】

3、【专利文献】

4、专利文献1：专利第6533930号公报

5、【发明的概要】

6、【发明要解决的课题】

7、但是，在计算疾病评价指标之前，有准备疾病风险系数表的必要。疾病风险系数表是指在指定的属性时，关于指定的肠内细菌丛和指定的疾病·健康状态的路径。

8、本发明关注于这样的课题而经锐意研究完成，其目的在于，提供即使使用者不回答详细的疾病罹患状况，也使用使用者的肠内细菌丛数据计算疾病评价指标的技术。

9、【用于解决课题的手段】

10、为了解决上述课题，第1发明是疾病评价指标计算系统，其具备输入使用者期望研究的1个或多个疾病的输入部，存储作为对多个受试者的大便进行解析的结果的肠内细菌丛相关数据的第1数据库、存储向上述受试者的关于上述疾病的问卷结果数据的第2数据库、使用指定的提取条件提取健康的人的第1肠内细菌丛数据及罹患上述疾病的人的第2肠内细菌丛数据的提取部，输入上述第1肠内细菌丛数据及上述第2肠内细菌丛数据、以及，上述问卷结果数据，制成关于显示上述第1肠内细菌丛数据和上述第2肠内细菌丛数据的差异的1个或多个菌的第1观测变量、表示上述疾病的罹患状况的第2观测变量、与上述第1观测变量及上述第2观测变量相关的1个或多个潜在变量、以及，从上述1个或多个潜在变量到上述第1及上述第2观测变量间的参数、和/或，由上述多个潜在变量间的参数构成的关联模型的第1制成部，以上述第1观测变量作为说明变量，制成以上述潜在变量的得分作为目的变量的得分推定模型的第2制成部，向上述得分推定模型的上述说明变量输入上述使用者的肠内细菌丛数据，推定上述潜在变量的得分的推定部，使用从上述1个或多个潜在变量到上述第2观测变量的参数、和/或，上述多个潜在变量间的参数、上述推定的得分，计算上述使用者对于上述疾病的风险的计算部。

11、第2发明是从上述1个或多个潜在变量到上述第2观测变量的参数是从上述1个或多个潜在变量到上述第2观测变量的路径系数的第1发明中记载的疾病评价指标计算系统。

12、第3发明是上述第1观测变量是作为在上述第1肠内细菌丛数据和上述第2肠内细菌丛数据之间在存在量有显著差异的菌的第1发明中记载的疾病评价指标计算系统。

13、第4发明是在上述第2观测变量是2值的类别变量时，上述计算部使用逻辑回归模型的第1发明中记载的疾病评价指标计算系统。

14、第5发明是罹患上述疾病的人含现在罹患的人和/或过去罹患的人的第1发明中记载的疾病评价指标计算系统。

15、第6发明是还具备以效果量作为指标，挑选上述1个或多个菌的挑选部的第1发明中记载的疾病评价指标计算系统。

16、第7发明是上述第2制成部从上述关联模型提取显示从上述潜在变量到上述第1观测变量的影响的测定方程式模型，将与上述测定方程式模型的各参数的值相同的值设定为上述得分推定模型的各参数的值的第1发明中记载的疾病评价指标计算系统。

17、第8发明是上述第2制成部还具备使用上述第1肠内细菌丛数据及上述第2肠内细菌丛数据，学习上述得分推定模型的各参数的值的学习部的第7发明中记载的疾病评价指标计算系统。

18、第9发明是在上述疾病是多个时，上述第1制成部对每个上述疾病制成多个上述关联模型，上述第2制成部对每个上述疾病制成多个上述得分推定模型，上述计算部计算每上述疾病的上述风险、或者，对于上述多个疾病的上述风险的第1发明中记载的疾病评价指标计算系统。

19、第10发明是在上述疾病是多个时，关于上述疾病的第2观测变量成为多个，上述第1制成部向上述关联模型加关于上述多个第2观测变量的其他潜在变量，上述计算部从上述推定的得分推定上述其他潜在变量的得分，使用从上述其他潜在变量到上述第2观测变量的上述参数、上述其他潜在变量的得分，计算上述使用者对于上述多个疾病的风险的第1发明中记载的疾病评价指标计算系统。

20、第11发明是利用计算机的疾病评价指标计算方法，计算机接受使用者期望欲研究的1个或多个疾病的输入，使用存储作为对多个受试者的大便进行解析的结果的肠内细菌丛相关数据的第1数据库、存储向上述受试者的关于上述疾病的问卷结果数据的第2数据库、指定的提取条件提取健康的人的第1肠内细菌丛数据及罹患上述疾病的人的第2肠内细菌丛数据，输入上述第1肠内细菌丛数据及上述第2肠内细菌丛数据、以及，上述问卷结果数据，制成关于显示上述第1肠内细菌丛数据和上述第2肠内细菌丛数据的差异的1个或多个菌的第1观测变量、表示上述疾病的罹患状况的第2观测变量、与上述第1观测变量及上述第2观测变量相关的1个或多个潜在变量、以及，从上述1个或多个潜在变量到上述第1及上述第2观测变量间的参数、和/或，由上述多个潜在变量间的参数构成的关联模型，以上述第1观测变量作为说明变量，制成以上述潜在变量的得分作为目的变量的得分推定模型，向上述得分推定模型的上述说明变量输入上述使用者的肠内细菌丛数据，推定上述潜在变量的得分，使用从上述1个或多个潜在变量到上述第2观测变量的参数、和/或，上述多个潜在变量间的参数、上述推定的得分，计算上述使用者对于上述疾病的风险。

21、第12发明是使计算机执行下列步骤的疾病评价指标计算程序：接受使用者期望欲研究的1个或多个疾病的输入的输入步骤，使用存储作为解析多个受试者的大便的结果的关于肠内细菌丛的数据的第1数据库、存储向上述受试者的关于上述疾病的问卷结果数据的第2数据库、指定的提取条件提取健康的人的第1肠内细菌丛数据及罹患上述疾病的人的第2肠内细菌丛数据的提取步骤，输入上述第1肠内细菌丛数据及上述第2肠内细菌丛数据、以及，上述问卷结果数据，关于显示上述第1肠内细菌丛数据和上述第2肠内细菌丛数据的差异的1个或多个菌的第1观测变量、表示上述疾病的罹患状况的第2观测变量、与上述第1观测变量及上述第2观测变量相关的1个或多个潜在变量、以及，从上述1个或多个潜在变量制成由上述第1及上述第2观测变量间的参数、和/或，上述多个潜在变量间的参数构成的关联模型的第1制成步骤，以上述第1观测变量作为说明变量，制成以上述潜在变量的得分作为目的变量的得分推定模型的第2制成步骤，向上述得分推定模型的上述说明变量输入上述使用者的肠内细菌丛数据，推定上述潜在变量的得分的推定步骤，使用从上述1个或多个潜在变量到上述第2观测变量的参数、和/或，上述多个潜在变量间的参数、上述推定的得分，计算上述使用者对于上述疾病的风险的计算步骤。

22、【发明的效果】

23、由本发明，即使使用者不回答详细的疾病罹患状况，也可提供使用使用者的肠内细菌丛数据计算疾病评价指标的技术。

24、【附图的简单的说明】

25、【图1】是本发明的实施方式涉及的疾病评价指标计算系统的整体概略图。

26、【图2】是本实施方式涉及的疾病评价指标计算处理的流程图。

27、【图3】是显示本实施方式涉及的对照组的条件的表。

28、【图4】是显示本实施方式涉及的仅特应反应罹患组的条件的表。

29、【图5】是显示本实施方式涉及的特应反应及他疾病罹患组的条件的表。

30、【图6】是显示本实施方式涉及之外疾病罹患组的条件的表。

31、【图7】是用于对本实施方式涉及的菌变量的挑选进行说明的图。

32、【图8】是用于对本实施方式涉及的成为挑选的候选的菌属数的变迁进行说明的图。

33、【图9】是显示本实施方式涉及的推定关联模型的参数的结果的图。

34、【图10】是显示本实施方式涉及的对于特应反应的风险值的roc分析的结果的图。

35、【图11】是显示变形例2涉及的多个关联模型的概要的图。

36、【图12】是显示变形例3涉及的关联模型的概要的图。

技术实现思路