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一种弥漫性大B细胞淋巴瘤的预后评估模型构建方法与流程

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一种弥漫性大B细胞淋巴瘤的预后评估模型构建方法与流程

本发明属于生物,具体涉及一种针对弥漫性大b细胞淋巴瘤的预后评估模型构建方法。


背景技术:

1、弥漫性大b细胞淋巴瘤(dlbcl)是一种侵袭性的成熟b细胞淋巴肿瘤,是最常见的淋巴瘤亚型,占全部的25%-50%。dlbcl患者的临床异质性大,预后也有较大的差异。基于一线标准r-chop(利妥昔单抗、环磷酰胺、多柔比星、长春新碱、泼尼松)方案的治疗,约60%的患者可以达到临床治愈,剩余约40%的患者发展为复发/难治性疾病。然而复发/难治性患者较难在初诊时完全区分并识别。因此,临床尝试通过多种分型及预后评估系统以尽可能识别此类患者,并予以强化治疗以改善其预后。以前细胞起源(coo)分型是临床常使用的分型系统,可分为生发中心b细胞样(gcb)、活化b细胞样(abc)及第三型。abc亚型的治疗反应显著低于gcb亚型,预后相对较差。然而随着实践的深入,发现gcb和abc亚型内部也存在显著异质性,仅凭coo分型不足识别复发/难治患者,临床存在许多未被满足的需求。研究者后续也尝试“双打击”、“双表达”淋巴瘤的识别,但仍不能满足临床需要。近年来,随着生物学技术的发展,尤其二代测序技术的广泛应用,研究人员对疾病的认识越来越深,dlbcl分型逐步进入基于遗传学特征的分型时代。2018年首次提出dlbcl的分子分型,将dlbcl分为mcd、bn2、n1、ezb四型。2020年基于lymphgen算法进行细化,分为mcd、n1、a53、bn2、st2、ezb六型,并提出潜在的靶向治疗。2023年我国学者基于lymphplex将lymphgen分子分型进行简化,分为tp53mut、mcd-like、bn2-like、n1-like、ezb-like、st2-like,并结合分子分型提出了r-chop+“x”方案以改善患者的预后。

2、国际预后指数(ipi)、年龄调整ipi(aaipi)及美国国家综合癌症网络修订ipi(nccn-ipi)评估模型仍然是预测dlbcl患者预后的主要临床工具。以上评估模型纳入的参数包括年龄、血清乳酸脱氢酶(ldh)、体力状况(ps)评分、ann arbor分期、结外累及位点、肾脏或肾上腺累及。然而,此类模型并没有纳入患者分子生物学改变,同时临床应用上对高危患者的评估效能显著下降。因此临床上迫切需要一种基于分子生物学改变的模型以综合评估患者的预后。


技术实现思路

1、针对上述现有预后评估模型的不足及临床需要,本发明提供一种基于分子生物学改变及ipi的新型dlbcl预后评估模型及其构建方法和应用,用于在当前分子分型指导下更精准评估dlbcl患者的预后。

2、本发明将通过以下技术方案实现上述发明目的:

3、本发明一方面提供一种弥漫性大b细胞淋巴瘤预后评估模型的构建方法,包括以下步骤:

4、(1)收集患者ipi评估系统所需数据,并检测样本中的pim1、ezh2、b2m、klhl4、cd79b、myc、stat3基因是否突变;所述患者ipi评估系统所需数据包括患者的年龄、血清ldh值、ps评分、annarbor分期、结外累及位点数量;

5、(2)根据步骤(1)收集的ipi评估系统所需数据,当满足年龄>60岁,记1分,否则0分;血清ldh值>正常值上限220u/l,记1分,否则0分;体力状况(ps)评分≥2,记1分,否则0分;annarbor分期≥iii期,记1分,否则0分;结外累及位点数量>1个,记1分,否则0分;将上述五项结果的总和作为ipi分数,最低0分,最高5分;

6、(3)当步骤(1)检测的七种基因发生突变时,按照如下规则计分:如果pim1基因发生突变时,pim1=1,否则pim1=0;如果ezh2基因发生突变时,ezh2=1,否则ezh2=0;如果b2m基因发生突变时,b2m=1,否则b2m=0;如果klhl4基因发生突变时,klhl4=1,否则klhl4=0;如果cd79b基因发生突变时,cd79b=1,否则cd79b=0;如果myc基因发生突变时,myc=1,否则myc=0;如果stat3基因发生突变时,stat3=1,否则stat3=0;

7、(4)将步骤(2)得到的ipi分数和步骤(3)得到的各种基因突变对应的计分代入如下公式计算得到ipi-m值:

8、ipi-m=0.461×ipi+0.442×pim1-0.842×ezh2-0.805×b2m+0.520×klhl14+0.539×cd79b+0.611×myc-1.233×stat3;

9、(5)根据步骤(4)中计算得到的ipi-m值进行分组并进行预后评估,其中,ipi-m值≤0.0为极低危组,0.0<ipi-m值≤0.5为低危组,0.5<ipi-m值≤1.5为中危组,1.5<ipi-m值≤2.0为高危组,ipi-m值>2.0为极高危组。

10、优选的,所述预后评估模型用于对受试者的总生存期进行预测评估。

11、本发明的第二方面提供一种弥漫性大b细胞淋巴瘤预后风险评估系统,所述预后风险评估系统包括:

12、(1)分析模块:所述分析模块用于获取受试者ipi评分相关数据,以及pim1、ezh2、b2m、klhl4、cd79b、myc、stat3基因突变数据;以及

13、(2)评估模块:所述评估模块根据获取得到的ipi评分相关数据和基因突变数据,分别赋予其对应的评估分值,根据计算公式获得总分值,从而输出受试者对应的预后状态,实现对弥漫性大b细胞淋巴瘤预后风险评估。

14、优选的,所述分析模块中受试者ipi评分相关数据包括受试者的年龄、血清ldh值、ps评分、annarbor分期、结外累及位点数量。

15、优选的,所述评估模块中按照下述规则对ipi评分相关数据赋予评分分值:当满足年龄>60岁,记1分,否则0分;血清ldh值>正常值上限220u/l,记1分,否则0分;ps评分≥2,记1分,否则0分;annarbor分期≥iii期,记1分,否则0分;结外累及位点数量>1个,记1分,否则0分;将上述五项结果的总和作为ipi分数。

16、优选的,所述评估模块中按照如下规则对基因突变数据赋予评分分值:如果pim1基因发生突变时,pim1=1,否则pim1=0;如果ezh2基因发生突变时,ezh2=1,否则ezh2=0;如果b2m基因发生突变时,b2m=1,否则b2m=0;如果klhl4基因发生突变时,klhl4=1,否则klhl4=0;如果cd79b基因发生突变时,cd79b=1,否则cd79b=0;如果myc基因发生突变时,myc=1,否则myc=0;如果stat3基因发生突变时,stat3=1,否则stat3=0;

17、优选的,所述评估模块中的总分值ipi-m的计算公式如下:

18、ipi-m=0.461×ipi+0.442×pim1-0.842×ezh2-0.805×b2m+0.520×klhl14+0.539×cd79b+0.611×myc-1.233×stat3。

19、优选的,所述评估模块中预后状态的评价标准如下:ipi-m值≤0.0为极低危组,0.0<ipi-m值≤0.5为低危组,0.5<ipi-m值≤1.5为中危组,1.5<ipi-m值≤2.0为高危组,ipi-m值>2.0为极高危组。

20、本发明的第三方面提供一种用于弥漫性大b细胞淋巴瘤预后评估的基因组合物,所述基因组合物包含突变的pim1、ezh2、b2m、klhl4、cd79b、myc和stat3基因。

21、本发明的第四方面提供检测基因组合物表达量的试剂在制备弥漫性大b细胞淋巴瘤预后试剂盒中的应用,所述基因组合物包含发生突变的pim1、ezh2、b2m、klhl4、cd79b、myc和stat3基因。

22、本发明的有益效果:

23、本发明结合ipi及基因突变构建评估dlbcl预后模型,在现有ipi模型基础上,结合分子突变特征,充分考虑常见基因突变的影响,将pim1、ezh2、b2m、klhl4、cd79b、myc、stat3基因突变因素纳入评估模型中,使dlbcl患者在初诊时被全面评估,为患者后续的治疗提供重要指导,具有良好的临床应用价值。

文档序号 : 【 40126906 】

技术研发人员:周静东,张婷娟,徐子浚,乔靓,钱军
技术所有人:镇江市第一人民医院

备 注:该技术已申请专利,仅供学习研究,如用于商业用途,请联系技术所有人。
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