基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法与流程
技术特征:
1.一种基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,在所述ctcbiopsy系统中,所用滤膜的孔径为8μm。
3.根据权利要求1所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,步骤s1包括:
4.根据权利要求3所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,若所述靶细胞符合至少4种情形可确认为循环肿瘤细胞,若所述靶细胞具有情形⑥且同时符合其他两种情形可确认为循环肿瘤细胞,若所述靶细胞仅具有情形⑥或符合其他任意三种情形可确认为疑似循环肿瘤细胞。
5.根据权利要求1所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,步骤s2具体为:先采用malbac全基因组扩增试剂盒进行靶细胞基因组扩增,再利用二代测序技术进行低深度全基因组测序。
6.根据权利要求1所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,步骤s3对测序数据进行cnv分析。
7.根据权利要求6所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,步骤s3具体包括:
8.根据权利要求7所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,步骤s31所述质控的条件为:
9.根据权利要求7所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,步骤s32所述参考基因组为人类基因组参考序列grch38。
10.根据权利要求1所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,所述循环肿瘤细胞包括来自于肺癌、胃癌、结肠腺癌、胶质瘤和乳腺癌的循环肿瘤细胞。
技术总结
本发明属于生物信息学技术领域,公开了一种基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,具体为:采集患者外周血样本,通过物理方法(CTCBIOPSY系统)分离富集循环肿瘤细胞,对细胞染色后根据细胞形态鉴定肿瘤细胞,通过激光显微切割挑取靶细胞,对靶细胞进行全细胞扩增和测序后,对测序数据分析以获得靶细胞遗传变异信息。本发明方法可以为CTC检测提供基因组的分子生物学信息,为临床提供更为精确的肿瘤信息,对肿瘤的早期诊断和治疗监测均具有重要意义。
技术研发人员:吴高,杨运强,吴长发,邓钢,徐智高,徐凡,阚光雄,李元娥,黄佳玉,柯晓明,魏亮,姚远
受保护的技术使用者:武汉友芝友医疗科技股份有限公司
技术研发日:
技术公布日:2024/11/28
文档序号 :
【 40164348 】
技术研发人员:吴高,杨运强,吴长发,邓钢,徐智高,徐凡,阚光雄,李元娥,黄佳玉,柯晓明,魏亮,姚远
技术所有人:武汉友芝友医疗科技股份有限公司
备 注:该技术已申请专利,仅供学习研究,如用于商业用途,请联系技术所有人。
声 明 :此信息收集于网络,如果你是此专利的发明人不想本网站收录此信息请联系我们,我们会在第一时间删除
技术研发人员:吴高,杨运强,吴长发,邓钢,徐智高,徐凡,阚光雄,李元娥,黄佳玉,柯晓明,魏亮,姚远
技术所有人:武汉友芝友医疗科技股份有限公司
备 注:该技术已申请专利,仅供学习研究,如用于商业用途,请联系技术所有人。
声 明 :此信息收集于网络,如果你是此专利的发明人不想本网站收录此信息请联系我们,我们会在第一时间删除