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基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法与流程

2025-03-07 14:00:02 437次浏览

技术特征:

1.一种基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,在所述ctcbiopsy系统中,所用滤膜的孔径为8μm。

3.根据权利要求1所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,步骤s1包括:

4.根据权利要求3所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,若所述靶细胞符合至少4种情形可确认为循环肿瘤细胞,若所述靶细胞具有情形⑥且同时符合其他两种情形可确认为循环肿瘤细胞,若所述靶细胞仅具有情形⑥或符合其他任意三种情形可确认为疑似循环肿瘤细胞。

5.根据权利要求1所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,步骤s2具体为:先采用malbac全基因组扩增试剂盒进行靶细胞基因组扩增,再利用二代测序技术进行低深度全基因组测序。

6.根据权利要求1所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,步骤s3对测序数据进行cnv分析。

7.根据权利要求6所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,步骤s3具体包括:

8.根据权利要求7所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,步骤s31所述质控的条件为:

9.根据权利要求7所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,步骤s32所述参考基因组为人类基因组参考序列grch38。

10.根据权利要求1所述基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,其特征在于,所述循环肿瘤细胞包括来自于肺癌、胃癌、结肠腺癌、胶质瘤和乳腺癌的循环肿瘤细胞。


技术总结
本发明属于生物信息学技术领域,公开了一种基于物理学捕获循环肿瘤细胞的全基因组数据分析方法,具体为:采集患者外周血样本,通过物理方法(CTCBIOPSY系统)分离富集循环肿瘤细胞,对细胞染色后根据细胞形态鉴定肿瘤细胞,通过激光显微切割挑取靶细胞,对靶细胞进行全细胞扩增和测序后,对测序数据分析以获得靶细胞遗传变异信息。本发明方法可以为CTC检测提供基因组的分子生物学信息,为临床提供更为精确的肿瘤信息,对肿瘤的早期诊断和治疗监测均具有重要意义。

技术研发人员:吴高,杨运强,吴长发,邓钢,徐智高,徐凡,阚光雄,李元娥,黄佳玉,柯晓明,魏亮,姚远
受保护的技术使用者:武汉友芝友医疗科技股份有限公司
技术研发日:
技术公布日:2024/11/28
文档序号 : 【 40164348 】

技术研发人员:吴高,杨运强,吴长发,邓钢,徐智高,徐凡,阚光雄,李元娥,黄佳玉,柯晓明,魏亮,姚远
技术所有人:武汉友芝友医疗科技股份有限公司

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吴高杨运强吴长发邓钢徐智高徐凡阚光雄李元娥黄佳玉柯晓明魏亮姚远武汉友芝友医疗科技股份有限公司
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