用于评估细胞线粒体形态的方法及其系统与流程
技术特征:
1.一种方法,其包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述图像参数是定量图像参数。
3.根据权利要求1至2中任一项所述的方法,其中基于径向矩图像参数来评估所述细胞线粒体的所述形态。
4.根据权利要求3所述的方法,其中所述径向矩图像参数从基于从所述细胞线粒体测量的荧光、针对所述细胞线粒体测量的光损失、针对所述细胞线粒体测量的前向散射光、针对所述细胞线粒体测量的侧向散射光及其组合而生成的图像来计算。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中评估所述细胞线粒体的所述形态包括评估所述细胞线粒体的尺寸;或
6.根据权利要求5所述的方法,其中所述细胞线粒体的所述形状选自由球形、纺锤形、椭圆形、细长形和扁平形组成的组。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的方法,其中所述线粒体用一种或多种亲脂性阳离子荧光团标记。
8.根据权利要求7所述的方法,其中所述线粒体用与线粒体蛋白质形成共价键的荧光团标记;或
9.根据权利要求8所述的方法,其中所述亲脂性阳离子荧光团包含用于将所述荧光团结合至所述线粒体蛋白质的硫醇反应性部分。
10.根据权利要求1至9中任一项所述的方法,其中所述线粒体用对线粒体内膜进行染色的荧光团标记。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的方法,其中所计算的图像参数包括所述荧光团的径向矩。
12.根据权利要求1至11中任一项所述的方法,其中所述方法进一步包括计算所述细胞线粒体的所生成的图像的像素密度。
13.根据权利要求1至12中任一项所述的方法,其中所述图像参数通过确定所生成的图像中的像素总和来计算,所述像素总和由每个像素距所述细胞线粒体的形心的距离来加权。
14.根据权利要求13所述的方法,其中通过将所生成的图像中线粒体的像素的加权和与预定阈值进行比较来评估所述细胞线粒体的所述形态。
15.根据权利要求13所述的方法,其中当所生成的图像中线粒体的像素的加权和等于或超过预定阈值时,确定所述细胞被活化。
16.根据权利要求13所述的方法,其中当所生成的图像中线粒体的像素的加权和小于预定阈值时,确定所述细胞未被活化。
17.根据权利要求1至16中任一项所述的方法,其中所述方法包括基于所述细胞线粒体的所生成的图像、所计算的图像参数或其组合对所述细胞进行分类。
18.根据权利要求17所述的方法,其中对所述细胞进行分类包括将所述细胞分配给一个或多个粒子群聚类。
19.根据权利要求17至18中任一项所述的方法,其中所述方法进一步包括为所述样品的所分类的细胞确定一个或多个分选门。
20.根据权利要求19所述的方法,其中所述一个或多个分选门捕获包含目标粒子群聚类的线粒体的细胞并且排除非目标粒子群聚类的粒子。
21.根据权利要求20所述的方法,其中所述目标粒子群聚类包括具有具有预定尺寸的细胞线粒体的细胞;或
22.根据权利要求20所述的方法,其中所述非目标粒子群聚类包括具有小于预定阈值的细胞线粒体的细胞;或
23.根据权利要求20至22中任一项所述的方法,其中所述分选门使目标粒子群聚类的细胞的包含产率最大化;或
24.根据权利要求1至23中任一项所述的方法,其中所述方法进一步包括将所述样品的细胞分选到多个样品容器中。
25.根据权利要求1至24中任一项所述的方法,其中测量来自所述流动流中细胞的光包括检测荧光、光吸收、散射光或其组合。
26.根据权利要求1至25中任一项所述的方法,其中所述图像参数从来自荧光标记的细胞线粒体的频率编码的荧光数据计算。
27.根据权利要求1至26中任一项所述的方法,其进一步包括用光源照射所述流动流中的所述样品。
28.根据权利要求27所述的方法,其中用波长为200nm至800nm的光源照射所述流动流。
29.根据权利要求27至28中任一项所述的方法,其中所述方法包括用第一频移光束和第二频移光束照射所述流动流。
30.根据权利要求29所述的方法,其中所述第一频移光束包括本地振荡器(lo)光束,并且所述第二频移光束包括射频梳状光束。
31.根据权利要求29至30中任一项所述的方法,其进一步包括:
32.根据权利要求31所述的方法,其中所述激光器是连续波激光器。
33.一种系统,其包括:
34.一种非暂时性计算机可读存储介质,其包括存储在其上的指令,其中所述非暂时性计算机可读存储介质包括:
技术总结
本公开的各方面包括用于评估细胞线粒体的形态的方法(例如,用于确定样品的细胞的生存力)。根据某些实施方案的方法包括测量来自具有荧光标记的线粒体的样品中的细胞的光,从所测量的光生成细胞线粒体的图像,从细胞线粒体的所生成的图像计算图像参数,以及基于所计算的图像参数来评估细胞线粒体的形态。还描述了用于实践主题方法的系统和集成电路设备(例如现场可编程门阵列)。还提供了非暂时性计算机可读存储介质。
技术研发人员:雪莉·石,路易斯·玛利亚·德克鲁兹,亚伦·雅各布·米德尔布鲁克,斯蒂芬妮·J·维德曼,亚伦·泰齐克
受保护的技术使用者:贝克顿·迪金森公司
技术研发日:
技术公布日:2024/11/14
技术研发人员:雪莉·石,路易斯·玛利亚·德克鲁兹,亚伦·雅各布·米德尔布鲁克,斯蒂芬妮·J·维德曼,亚伦·泰齐克
技术所有人:贝克顿·迪金森公司
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